Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trim41Q5NCC3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms