Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms