Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf354cQ571J5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms