Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrmoQ562D6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms