Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms