Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Esf1Q3V1V3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms