Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b4Q3V0X2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms