Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms