Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
D130052B06RikQ3UW13 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms