Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV70

Pdp1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp1Q3UV70 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdp1Q3UV70 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdp1Q3UV70 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms