Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A530084C06RikQ3UTW2 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms