Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3USZ8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3USZ8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3USZ8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3USZ8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q3USZ8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3USZ8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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