Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms