Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms