Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms