Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB5

Smcr8, Guanine nucleotide exchange protein SMCR8, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smcr8Q3UMB5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smcr8Q3UMB5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms