Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms