Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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