Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm648Q3UJ22 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm648Q3UJ22 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm648Q3UJ22 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm648Q3UJ22 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm648Q3UJ22 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm648Q3UJ22 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm648Q3UJ22 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm648Q3UJ22 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm648Q3UJ22 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm648Q3UJ22 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm648Q3UJ22 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm648Q3UJ22 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm648Q3UJ22 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms