Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms