Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf44Q3UHJ8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf44Q3UHJ8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf44Q3UHJ8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf44Q3UHJ8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf44Q3UHJ8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf44Q3UHJ8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf44Q3UHJ8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf44Q3UHJ8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf44Q3UHJ8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf44Q3UHJ8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms