Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms