Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Yipf3Q3UDR8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms