Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U595 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U595 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U595 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U595 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U595 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U595 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U595 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U595 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U595 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U595 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U595 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U595 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U595 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U595 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U595 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U595 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms