Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hbq1bQ3U0A6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hbq1bQ3U0A6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hbq1bQ3U0A6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hbq1bQ3U0A6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hbq1bQ3U0A6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hbq1bQ3U0A6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hbq1bQ3U0A6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Hbq1bQ3U0A6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Hbq1bQ3U0A6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Hbq1bQ3U0A6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hbq1bQ3U0A6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms