Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms