Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms