Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms