Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm1123Q1RME4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1123Q1RME4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms