Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms