Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli2Q0VGT2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli2Q0VGT2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms