Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc3h18Q0P678 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zc3h18Q0P678 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms