Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms