Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnma1Q08460 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms