Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms