Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms