Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms