Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms