Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms