Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms