Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms