Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms