Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx1Q04742 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms