Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms