Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CkbQ04447 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms