Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms