Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms