Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms