Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms