Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms